Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN2Q96NB2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN2Q96NB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFXN2Q96NB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms