Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C2orf48Q96LS8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C2orf48Q96LS8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C2orf48Q96LS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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