Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG2Q96IQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG2Q96IQ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms