Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF34Q969K3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms