Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATD1Q8NB37 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms