Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA3Q8N6C8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LILRA3Q8N6C8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LILRA3Q8N6C8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms