Protein–RNA interactions for Protein: Q8N328

PGBD3, PiggyBac transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD3Q8N328 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD3Q8N328 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD3Q8N328 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms