Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP54Q7Z3B4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms