Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYS1Q717R9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYS1Q717R9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms