Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREML4Q6UXN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms