Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KHDC3LQ587J8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KHDC3LQ587J8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms