Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFNL1Q499Z3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFNL1Q499Z3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFNL1Q499Z3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms