Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN3Q08043 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN3Q08043 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms