Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVS71-1P61550 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVS71-1P61550 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVS71-1P61550 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms