Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBEYP58557 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBEYP58557 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBEYP58557 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBEYP58557 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBEYP58557 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBEYP58557 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBEYP58557 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YBEYP58557 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBEYP58557 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YBEYP58557 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBEYP58557 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YBEYP58557 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YBEYP58557 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBEYP58557 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YBEYP58557 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YBEYP58557 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms