Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFDNP55196 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFDNP55196 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFDNP55196 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFDNP55196 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFDNP55196 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFDNP55196 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFDNP55196 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFDNP55196 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFDNP55196 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFDNP55196 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFDNP55196 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFDNP55196 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AFDNP55196 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AFDNP55196 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AFDNP55196 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFDNP55196 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFDNP55196 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFDNP55196 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
AFDNP55196 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFDNP55196 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
AFDNP55196 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFDNP55196 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFDNP55196 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFDNP55196 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms