Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR1H2P55055 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H2P55055 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms