Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
THBS3P49746 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
THBS3P49746 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
THBS3P49746 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
THBS3P49746 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
THBS3P49746 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THBS3P49746 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THBS3P49746 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms