Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALR1P47211 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALR1P47211 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GALR1P47211 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GALR1P47211 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GALR1P47211 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms