Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCC3P46736 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCC3P46736 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms