Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCLP19338 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCLP19338 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCLP19338 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCLP19338 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCLP19338 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCLP19338 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCLP19338 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCLP19338 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCLP19338 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCLP19338 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCLP19338 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms