Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HSP90AB1P08238 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HSP90AB1P08238 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms