Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3DP05423 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms