Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX15O60248 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOX15O60248 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOX15O60248 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOX15O60248 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOX15O60248 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOX15O60248 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms