Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPAA1O43292 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPAA1O43292 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms