Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC10BA6NIK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms