Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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