Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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