Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms