Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLVAPQ9BX97 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms