Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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