Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYN1P17600 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYN1P17600 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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