Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms