Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SGF29Q96ES7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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