Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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