Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA6P23229 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms