Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms