Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FRMPD4Q14CM0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms