Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM23P36406 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms