Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms