Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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