Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PACSIN2Q9UNF0 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms