Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms