Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPB2P35606 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPB2P35606 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPB2P35606 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms