Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBP1P32455 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBP1P32455 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms