Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms