Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNA5P22460 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNA5P22460 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNA5P22460 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms