Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms