Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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DPM3Q9P2X0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DPM3Q9P2X0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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DPM3Q9P2X0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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DPM3Q9P2X0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DPM3Q9P2X0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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