Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRP2BPQ9P2M1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRP2BPQ9P2M1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms